Khakista Cavalier-Smith 1995 カキスタ亜門
Bacillariophyceae Haeckel 1878 珪藻綱
Bacillariophycanae
Bacillariales Hendey 1937 sensu emend.
Naviculales Bessey 1907 sensu emend.
Thalassiophysales D.G. Mann 1990
Eunotiophycanae
Coscinodiscophycidae Round & Crawford 1990
Biddulphianae
Hemiaulales Round & Crawford 1990
Triceratiales Round & Crawford 1990
Chaetocerotanae
Corethranae
Corethrales Round & Crawford 1990
Coscinodiscanae
Chrysanthemodiscales F.E. Round
Coscinodiscales Round & Crawford 1990
Cymatosirophycanae
Cymatosirales Round & Crawford 1990
Lithodesmiophycanae
Lithodesmiales Round & Crawford 1990
Rhizosolenianae
Thalassiosiranae
Thalassiosirales Glezer & Makarova 1986
Fragilariophycidae Round & Crawford 1990
Fragilariophycanae
Fragilariales Silva 1962 sensu emend.
Bolidophyceae Guillou & Chretiennot-Dinet 1999 ボリド藻綱
Phaeista Cavalier-Smith 2000 フェイスタ亜門
Chrysophyceae Pascher 1914 黄金色藻綱
Eustigmatophyceae Hibberd & Leedale 1971 真正眼点藻綱
Picophagea Cavalier-Smith 2006
Synchromophyceae Horn & Wilhelm 2007
Chrysomerophyceae Cavalier-Smith 1995 クリソメリス藻綱
Phaeophyceae Hansgirg 1886 褐藻綱
Dictypophycidae Silberfeld Rousseau & Reviers 2014
Dictyotales Bory de Saint-Vincent 1828 ex Phillips et al.
アミジグサ目
Onslowiales Draisma & Prud’homme van Reine 2008
Sphacelariales Migula 1909 クロガシラ目
Syringodermatales Henry 1984 ウスバオオギ目
Discosporangiophycidae Silberfeld Rousseau & Reviers 2014
Discosporangiales Schmidt 1937 emend. Kawai et al. 2007
Fucophycidae Cavalier-Smith 1986 ヒバマタ亜綱
Ectocarpales Bessey 1907 シオミドロ目
Fucales Bory de Saint-Vincent 1827 ヒバマタ目
Ralfsiales Nakamura ex Lim & Kawai 2007 イソガワラ目
Ascoseirales Petrov1964 emend. Moe & Henry 1982
Asterocladales T.Silberfeld et al. 2011
Desmarestiales Setchell & Gardner 1925 ウルシグサ目
Nemodermatales Parente et al. 2008
Scytothamnales Peters & Clayton 1998 emend. Silberfeld et al. 2011
Sporochnales Sauvageau 1926 ケヤリモ目
Tilopteridales Bessey 1907 emend. Phillips et al. 2008
Ishigeophycidae Silberfeld Rousseau & Reviers 2014
イシゲ亜綱
Ishigeales Cho & Boo 2004 イシゲ目
Phaeothamniophyceae Andersen & Bailey 1998 s.l.
ファエオタムニオン藻綱
Xanthophyceae Allorge 1930 emend. Fritsch 1935 黄緑藻綱
Hypogyristia Cavalier-Smith 1995
Dictyochophyceae P.C. Silva 1980 s.l. ディクティオカ藻綱
Pelagophyceae R.A.Andersen & G.W.Saunders 1993 ペラゴ藻綱
Raphidoistia Cavalier-Smith 1986
Raphidophyceae Chadefaud 1950 ex Silva 1980 s.l.
ラフィド藻綱